小麦黑穗病有腥黑穗病和散黑穗病等不同种类。腥黑穗病因病麦粒含三甲胺有鱼腥气味而得名，小麦收获时，病菌孢子黏附在种子表面，形成种子带菌；病菌孢子落于田间，形成土壤带菌。小麦种子发芽时，病菌孢子同时萌发，病菌菌丝从小麦芽鞘侵入麦苗，在植株内生长蔓延，最后使病株所有穗子的全部籽粒形成黑色菌瘿，造战毁灭性危害。散黑穗病主要危害小麦穗部，病株抽穗期略早于健株，初期病穗外面包有一层灰白色薄膜，病穗尖端略微露出苞叶时，即有黑粉散出。病穗抽出后，黑粉被风雨吹散，病穗上的小穗几乎全部被毁。一株发病，主茎和所有分蘖都出现病穗，抗病品种部分分蘖穗能正常结实。

    瑞士先正达作物保护有限公司的酷拉斯27%苯醚·咯·噻虫悬浮种衣剂（含苯醚甲环唑2.2%、咯菌腈2.2%、噻虫嗪22.6%），登记用于小麦包衣种子防治散黑穗病和金针虫，每100公斤种子推荐用纯药54～162克。每100公斤小麦种子用该药200毫升拌种，能有效防治黑穗病，还能有效防治全蚀病、根腐病、早期纹枯病等病害以及金针虫等地下害虫及早期蚜虫，同时能促进小麦根系生长，促进分蘖，增加单株有效茎蘖数。

    防治小麦黑穗病，还可以用戊唑醇悬浮种衣剂拌麦种，一般每100公斤麦种用戊唑醇纯药3～4克，同时能防治全蚀病、根腐病、早期纹枯病等病害，对赤霉病、苗腐病也有较好防效。拌种后小麦出苗期可能推迟一两天，但对小麦发芽率没有影响，而且苗齐苗壮，根系发达，叶色浓绿，叶片宽。用药量不能过大，拌100公斤麦种戊唑醇纯药用量如果超过6克，对小麦出苗率和出苗速度易产生较大不良影响。