由于天然产物不稳定，在紫外光、阳光和高温下极易分解。因此，除了避免强光、高温、强酸碱和酶外，在配制制剂过程中，可加入一种或多种环氧化植物油稳定剂和对氨基苯甲酸抗光剂，来抑制天然物的热分解与光降解。还可以通过选择适宜乳化剂来提高乳化稳定性。在植物中寻找具有农药生物活性的化合物作为先导化合物，通过结构上的修饰，或者人工模拟合成筛选，获得新型农药。菊酯类杀虫剂由来源于菊科植物中的除虫菊素修饰发展而来，源于豆科植物毒扁豆种子中毒扁豆碱的氨基甲酸苯酯，源于大蒜中大蒜素的抗菌素402等，这是国外植物源农药研究开发的重点，也是中国植物源农药研究发展的方向。