蚌埠市市场监督管理局11月13日发布的行政处罚信息公开表指出，湖北祥云(集团)化工股份有限公司生产经营不符合强制性标准的肥料、对其商品的性能、功能作虚假或者引人误解的商业宣传，市市场监管部门依据《中华人民共和国产品质量法》第四十九条、《中华人民共和国反不正当竞争法》第二十条和《中华人民共和国行政处罚法》第二十七条第一款第(一)、(四)项，对祥云股份处以罚款。

2018年11月12日，祥云股份因群众来电反映抽水棒工作时噪音大，同时产生大气污染，被要求正常情况下夜间九点后停止抽水作业，减少噪声对周边环境的影响，如遇暴雨等特殊情况确需夜间抽水，应公告群众，做好防治工作；责令对1号原料仓库加强密闭管理，减少库存量，防止异味飘散。

2016年9月15日，祥云股份因复混肥料总养分不符合强制性国家标准，被保康县质量技术监督局责令停止销售不合格的复混肥产品并罚款4000元。

2015年11月10日，祥云股份因16万吨/年硫铁矿制酸车间发生污染事故，排放二氧化硫气体危害周边村民的身体健康，被武穴市环境保护局责令迅速排除污染事故产生的危害，做好受损村民赔偿工作，并罚款4万元。

2014年9月22日至10月14日，湖北省环保厅会同黄冈市环保局对祥云股份等36家企业进行现场检查。经查，祥云股份的硫铁矿堆场建设不规范，防扬洒措施不到位；老厂硫酸车间废水收集循环池未采取防渗措施。

2014年1月10日，祥云股份以重大环境风险单位等级被列入湖北省较大以上环境风险等级国控企业名单。

2013年9月9日，祥云股份老厂、华新水泥(600801)(武穴)有限公司因#1和#2窑炉窑尾烟气污染源自动监控系统长期故障不能正常运行，无自动监控数据上传，未移交新国控运维单位运维，湖北省环境保护厅要求黄冈市环保局督促祥云股份等公司制定具体整改措施。

2013年1月4日，祥云股份因部分项目试生产时间过长；配套设施建设滞后；企业环境管理不到位，湖北省环境保护厅要求黄冈市环保局责令祥云股份加强环境管理，完善雨污分流，安装新厂区试生产项目在线监测系统并与环保部门联网，在规定期限内完成新建项目的环保竣工验收，逾期不能完成验收，应立即停产整改。

2012年11月26日，祥云股份因污水治理设施停运扩建、在线监控设施拆除未严格按规范程序履行报批手续，湖北省环境保护厅要求黄冈市环保局责令祥云股份限期恢复在线监控设施。