别名：棉花黑根病、棉花烂根病、棉花腰折病。
症状：主要为害棉苗。侵染幼茎茎基部初现纵褐条纹件适宜时迅速扩展绕茎一周，缢缩变细，出现茎基腐或根腐。棉苗失水较快，一般不倒伏。死苗易从土中拔出，其基部或根系上可见稀疏的丝状物及粘附在其上的小土粒。侵染种子引起烂种或烂芽，病种子多呈褐色软腐状，挤压时流出共黄褐色粘液。侵染子叶及幼嫩真形成不规则褐色坏死斑，后干枯穿孔。湿度大时病部可见稀疏白色菌丝体，并有褐色的小菌核粘附其上。
病原：病原为有性态为瓜亡革菌 Thanatephorus cucumeris (Frank) Donk.，属担子菌亚门真菌。无性态为立估枯丝核菌 Rhizoctomia solani Kühn .，属半知菌亚门真菌。
发病规律：病菌以分生孢子在棉籽短绒上越冬，少数以菌丝体潜伏于棉籽种皮内或子叶夹缝中越冬，种子带菌是重要的初侵染源。然后，病部产生分生孢子借风雨、昆虫及灌溉水传播。棉铃染病病菌侵入棉籽。发病的叶、茎、叶落入土中，造成土壤带菌，引起苗期发病、又可经雨水冲溅侵染棉铃，引起发病。
防治措施： (1)选用抗病品种。如晋棉16号(师棉5号)、晋棉21号等。进行大面积合理轮作。
(2)提倡施用酵素菌沤制的堆肥或腐熟有机肥及5406菌肥。精细整地，提高播种质量。
(3)播种前精选棉种，并用种子重量0.5%-0.8%的50%多菌灵可湿性粉剂或种子重种。
(4)提倡采用脱绒包衣棉种，可提早出苗3-4天，减少发病。
(5)适期早播，春棉花应在5cm深处土温稳定在14℃时播种，播深4-5cm。
(6)加强苗期管理，适当早间苗，适时早中耕，注意降低土壤湿度，提高地温，培育壮苗，雨后注意排水，防止湿气滞留。
(7)出苗后病害始发期，用80%退菌特或20%稻脚青可湿性粉剂1000倍液灌根，或用25%多菌灵可湿性粉剂500倍液喷棉苗2-3次。
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