黑麦秆锈病病菌在黑麦、大麦、冰草等植物上产生夏孢子、冬孢子，在小檗和十大功劳属植物上产生锈孢子和性孢子。但病菌在南方以夏孢子世代在麦苗上越冬，春季借风雨传播为害。雨量多、叶面潮湿、施氮过多以及温度在18～25℃时很容易引起黑麦秆锈病的发生。
黑麦秆锈病病部产生长椭圆形、铁锈色夏孢子堆，多先发生于叶背，散生，发病严重时愈合成长条形。成熟散出大量锈褐色粉末(夏孢子)。生长后期形成黑色冬孢子堆。
黑麦秆锈病防治方法：
1、用抗病黑麦品种
2、药剂防治：
①药剂拌种 用种子重量的0.03%-0.04%(有效成分)叶锈特或用种子重量0.2%的20%三唑酮乳油拌种。
②提供使用15%保丰1号种衣剂(活性成分为粉锈宁、多菌灵、辛硫磷)包衣种子后自动固化成膜状，播后形成保护圈，且持效期长。用量每kg种子用4g包衣防治小麦叶锈病、白粉病、全蚀病效果优异，且可兼治地下害虫。
③于黑麦孕穗至抽穗期病叶率达5%时，喷洒20%三唑酮乳油1000倍液可兼治条锈病、秆锈病和白粉病，隔10-20天1次，防治1-2次。
常用药剂 叶锈特、三唑酮、粉锈宁、多菌灵、辛硫磷、烯唑醇、粉唑醇、戊唑醇、丙环唑、氟环唑、硫悬浮剂、福·酮、硫·酮、甲硫·硫
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